В соответствии с Бюджетным кодексом, структуру государственного управления в области регулирования бюджетных отношений составляют:
- Президент РК;
- Парламент РК;
- Счетный комитет по контролю за исполнением республиканского бюджета;
- Правительство РК;
- Центральный уполномоченный орган по экономическому и бюджетному планированию - Министерство экономического развития и торговли РК;
- Центральный уполномоченный орган по исполнению бюджета - Министерство финансов РК;
- маслихат;
- местный исполнительный орган.
Непосредственное управление бюджетной системой осуществляет Правительство РК через центральные и местные уполномоченные органы по бюджетному планированию, исполнению бюджета и внутреннему контролю.
Министерство экономического развития и торговли РК является центральным исполнительным органом, осуществляющим межотраслевую и межрегиональную координацию разработки основных направлений государственной социально-экономической политики. Главной задачей Министерства является формирование целостной и эффективной системы государственного планирования, ориентированной на достижение стратегических целей и реализацию приоритетных задач социально-экономического развития страны, а также развитие торговой деятельности.
Министерство финансов РК является центральным исполнительным органом Республики Казахстан, осуществляющим руководство, а также в пределах, предусмотренных законодательством, межотраслевую координацию в сфере деятельности, отнесенной к его компетенции.