На нижестоящих уровнях бюджетной системы функции местных уполномоченных органов осуществляют соответствующие структуры масли- хатов и местных исполнительных органов.
Ключевыми органами управления государственными финансами в Казахстане являются Министерство экономического развития и торговли РК (МЭРТ) и Министерство финансов РК. Роль и значение этих министерств в управлении государственными финансами определяется значимостью выполняемых им функций и объемов решаемых задач.
Основными задачами МЭРТ являются выработка предложений по формированию государственной политики в сфере:
1) стратегического планирования и формирования основных приоритетов социально-экономического развития Республики Казахстан;
2) регионального развития;
3) международных экономических и финансовых отношений, в том числе регулирования международной экономической интеграции;
4) регулирования и развития внешнеторговой деятельности;
5) регулирования и развития внутренней торговли;
6) развития и поддержки частного предпринимательства;
7) инвестиций и государственно-частного партнерства;
8) управления государственными активами в секторах экономики;
9) развития системы государственного управления;
10) мобилизационной подготовки и мобилизации.
Министерство, исходя из задачи формирования государственной политики в области бюджетных отношений, осуществляет следующие стратегические функции:
1) разработку, корректировку, мониторинг и оценку реализации Стратегического плана развития Республики Казахстан;