Принятое решение комиссии оформляется протоколом, подписываемым председателем и секретарем комиссии и выражающим единое мнение всех членов комиссии. В случае несогласия с принятым решением члены комиссии вправе выразить в письменном виде свое особое мнение, приобщаемое к протоколу комиссии. Решения комиссии, принятые с целью выполнения возложенных на нее задач, подлежат обязательному рассмотрению и исполнению в указанный срок всеми государственными органами.
Рабочим органом комиссии является центральный уполномоченный орган по государственному планированию - Министерство экономического развития и торговли РК. В период между заседаниями комиссии организационные вопросы ее деятельности решает МЭРТ. Функциями рабочего органа являются подготовка материалов к заседаниям комиссии в соответствии со сроками и повестками дня, определяемыми комиссией или рабочим органом, рассылка их членам комиссии, подготовка протоколов заседаний комиссии, доведение выписок из протокольных решений комиссии членам комиссии, государственным органам и организациям по вопросам, входящим в их компетенцию, а также другие функции, вытекающие из нормативных правовых актов.
Основанием для прекращения деятельности комиссии является принятие Президентом Республики Казахстан решения о прекращении ее деятельности. При наступлении данного обстоятельства Президенту Республики Казахстан и Правительству комиссией направляется письмо-отчет о проделанной работе.
Ключевые слова: бюджетные комиссии, проект бюджета, источники финансирования, бюджетным мониторинг, оценка программ, секвестр бюджета, уточнение бюджета, технико-экономическое обоснование, концессионный проект.