После обретения независимости Казахстан лишившись прежних субвенций и дотаций из союзного бюджета, которые в 1991 году составили шестую часть бюджета нашей республики, а также ведомственных источников финансирования стал испытывать последствия кризиса отраслей и предприятий, бывших ранее в так называемом союзном подчинении и занимавших свыше 90% в общем объеме производства республики. Все это требовало создания новой бюджетной системы. Через государственный бюджет осуществлялось перераспределение преобладающей доли денежных доходов народного хозяйства. Государственный бюджет был финансовым источником расширенного воспроизводства большей части формально хозрасчётных предприятий и отраслей народного хозяйства и общим «котлом» доходов и расходов всего общества, всех его частей, национально-государственных структур.
В национальной экономике Казахстана в результате формирования рыночных основ экономики формируется иной, нежели это было при плановой экономике, тип бюджета и бюджетной системы. В централизованной экономике государственный бюджет являлся бюджетом всего народного хозяйства. Такая концепция организации бюджетной системы государства отражала огосударствление всего воспроизводственного процесса, централизацию производства, распределения, перераспределения и использования значительной части национального дохода, в том числе ресурсов накопления и возмещения, в масштабах государства.
Бюджетная система является важной составляющей частью всей финансовой системы государства. Бюджетная система как экономическая категория представляет собой совокупность финансовых отношений государства с юридическими, физическими лицами и регионами по формированию и использованию централизованного денежного фонда - бюджетов, методов и способов их формирования и исполнения, а также совокупность органов управления этими отношениями. Другими словами, под бюджетной системой понимается совокупность бюджетов всех уровней и Национального фонда Республики Казахстан, а также бюджетного процесса и бюджетных отношений, основанных на экономических отношениях и правовых нормах.