Впервые законодательно было определено, что все государственные учреждения не вправе брать на себя финансовые обязательства сверх сумм бюджетных назначений, установленных бюджетным законодательством на соответствующий финансовый год. Созданные на постоянной основе бюджетные комиссии позволили решить приоритетный для республики вопрос: обеспечение рационализации затрат государства при формировании бюджета на очередной год. Было осуществлено разделение государственного бюджета на текущий бюджет, за счет которого, осуществлялись программы, направленные на выполнение текущих нужд государства, и бюджет развития, включающий инвестиционные расходы в экономику, т.е. расходы на развитие инфраструктуры, градостроительство, создание и развитие информационных систем, науку, инвестиций в человеческий капитал и т. п. Такое разделение бюджета позволило реально оценить стоимость выполнения государством своих функций, определенных законодательством и направленных на содержание имеющейся сети государственных учреждений, объем инвестиционного вклада государства в социально-экономическое развитие, а также систематизировать бюджетные программы.
Одновременно с совершенствованием бюджетной системы была проведена работа по приближению налоговой системы к реалиям времени. Первым шагом к этому стало принятие в 1995 году Закона «О налогах и других обязательных платежах в бюджет», позволившего повысить эффективность налоговой системы. С принятием данного нормативного акта налоговая политика была направлена не на увеличение числа налогов, а на упрощение системы налогообложения.
В 2005 году в Казахстане вступил в действие Бюджетный кодекс - Закон, который регулирует бюджетные и межбюджетные отношения и устанавливает основные положения, принципы и механизмы функционирования бюджетной системы, образования и использования бюджетных средств, а так же регламентирует все финансовые процедуры, начиная от формирования бюджета и заканчивая его исполнением и контролем. Особенность Бюджетного кодекса состояла в том, что в нем были заложены новые принципы организации бюджетной системы, бюджетного планирования, подходы к формированию доходной и расходной части бюджетов всех уровней. Внесены изменения по разработке среднесрочного бюджетного планирования, усиления роли государственного финансового контроля за использованием бюджетных средств.