Организация обороны включает в себя осуществление ряда мероприятий, направленных на предотвращение войн: прогнозирование и оценка военной угрозы, разработка военной политики и военной доктрины, организацию обороны государственной границы, подготовку и осуществление мероприятий гражданской и территориальной обороны, мобилизационную подготовку экономики, государственных органов и системы управления и функционированию в военное время, подготовку населения и территорий к обороне, создание запасов материальных ценностей в государственном и мобилизационных резервах.
Основой планирования расходов на нужды обороны является Новая Военная доктрина Республики Казахстан, утвержденная Указом Президента Республики Казахстан от 21 марта 2007 года, согласно которой объем расходов на оборону предусматривается в размере не менее 1% ВВП, в которой определены этапы строительства, реформирования Вооруженных Сил Республики Казахстан и основные направления военно-экономического обеспечения.
Государственное планирование и обеспечение потребностей обороны республики осуществляет Министерство торговли и экономического развития, которое в составе проектов экономического и социального развития предусматривает заказы на государственные нужды реализации программ развития вооружений и военной техники в интересах обороны республики, строительство объектов оборонного назначения, а также мероприятий гражданской обороны, подготовку и переподготовку специалистов и внедрение необходимых для этого материальных и финансовых ресурсов. Другие министерства и ведомства разрабатывают проекты планов выпуска и постановок вооружения и военной техники, создания, развития и сохранения мобилизационных мощностей, постановок продовольственных товаров и вещевого имущества для нужд обороны и иные оборонные задачи.